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配合中正國際機場三期航站興建，未來中正航空科學館將拆除。
記者陳嘉寧／攝影

因應觀光客倍增計畫及未來兩岸直航進出旅次大幅成長，中正機場三期航站興建計畫已積極進行。行政院經建會鑒於政府財政困難，主張開放民間投資營運管理(BOT)，並希望未來入出境統一於第三航廈辦理，民航局則認為，仍應由政府主導的民航基金支應預算較為適宜，一、二航廈不再辦理搭機手續，會衍生很多困難，雙方歧見很大。

第二航站啟用至今滿4年，連同第一航站，1年旅次能量為3200萬人次，而目前中正機場1年最高旅客進出量僅約1900萬人次，去年受SARS影響，來台旅客全年降到1600萬人次以下，在這種離飽和狀況仍遠的情況下，一般人多會質疑沒有必要急著提早興建。

實際不然，按照旅客成長基本發展預估，至民國100年，一年旅次約2900萬人次；但如果考量觀光客倍增計畫的推動因素，屆時旅客成長量已超越3200萬人次負荷；再加上兩岸保守性開放直航之後後，估計將達4000萬人次。預估民國105年將達4500萬人次，110年為5300萬人次以上。即使不考量後兩項因素，到105年基本成長量也達3155萬人次，屆時一、二航站將達到飽和。依據一個航站從規畫、設計、發包、施工、驗收等程序到完工，平均要10年時程，過去興建第二航站就花了11年，以此倒推計算，時間將非常緊迫，何況第三航站佔地約50公頃，比第一航站16公頃、第二航站20公頃大得多，而且當中還配合設置交通運輸管制中心，連接高鐵、台鐵、捷運、機場內部捷運（PMS）公路各大運輸系統，工程非常複雜，不及早因應絕來不及。

根據民航局委託財務分析公司估計，三期航站興建經費約445億元（民國92年幣值），經建會認為應該完全將三期計畫工程全部BOT出去，而且未來最好全部集中在第三航站作業，一、二航站僅供登機用，甚至整個入出境簽證、安檢、檢疫等工作均可委託民間專業公司辦理，政府僅站在監督者角色即可。